Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
Traf3ip1Q149C2 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Traf3ip1Q149C2 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms