Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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Sh3bp1P55194 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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Sh3bp1P55194 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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