Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Hoxd9P28357 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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Hoxd9P28357 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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