Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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Limd1Q9QXD8 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Limd1Q9QXD8 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Limd1Q9QXD8 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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