Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Cntn3Q07409 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cntn3Q07409 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms