Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
VdrP48281 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VdrP48281 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VdrP48281 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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VdrP48281 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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VdrP48281 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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