Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26992S4R1A3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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