Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms