Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms