Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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