Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms