Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.7 ms