Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
D17h6s53eQ9Z1R4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms