Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog1Q9Z160 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms