Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms