Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NgfrQ9Z0W1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NgfrQ9Z0W1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms