Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp2Q9Z0E6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms