Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pmfbp1Q9WVQ0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms