Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx1Q9WV80 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms