Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhx6Q9R1R0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms