Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms