Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slit2Q9R1B9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slit2Q9R1B9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms