Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfwd2Q9R1A8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfwd2Q9R1A8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms