Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zeb2Q9R0G7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zeb2Q9R0G7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms