Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms