Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AmfrQ9R049 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AmfrQ9R049 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms