Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms