Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps29Q9QZ88 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps29Q9QZ88 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms