Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms