Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt3Q9QZ47 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms