Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tomm40Q9QYA2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms