Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms