Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ehd3Q9QXY6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ehd3Q9QXY6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms