Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk1nQ9QXV0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcsk1nQ9QXV0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms