Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms