Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PdcQ9QW08 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PdcQ9QW08 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms