Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rai2Q9QVY8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rai2Q9QVY8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms