Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln8Q9QUK3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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