Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2bQ9JME9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms