Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabgef1Q9JM13 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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