Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms