Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd2apQ9JLQ0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms