Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmod4Q9JLH8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmod4Q9JLH8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 847.9 ms