Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefQ9JLC6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TefQ9JLC6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms