Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msrb1Q9JLC3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms