Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms