Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms