Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms