Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcan3Q9JKK0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcan3Q9JKK0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms