Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms